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| 2 | ## FILE: TOLutils.R |
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| 3 | ## PURPOSE: Communication API between TOL and R |
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| 4 | ## AUTHOR: josp@tol-prj.org |
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| 5 | ## |
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| 6 | ## ACKNOWLEDGEMENTS: |
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| 8 | ## R Development Core Team (2007). R: A language and environment for |
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| 9 | ## statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, " |
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| 10 | ## Vienna, Austria. ISBN 3-900051-07-0, \n" |
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| 11 | ## URL http://www.R-project.org.\n"}; |
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| 12 | ## |
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| 16 | read.bbm <- |
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| 18 | function(fbbm) { |
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| 19 | fd = file(fbbm, open='rb') |
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| 20 | dim <- readBin(fd,integer(), n=2) |
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| 21 | data<-readBin(fd,double(),n=dim[1]*dim[2]) |
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| 22 | close(fd) |
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| 23 | matrix(data, nrow=dim[1], ncol=dim[2], byrow=TRUE) |
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| 24 | } |
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| 26 | ################################################################################ |
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| 27 | write.bbm <- |
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| 28 | ################################################################################ |
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| 29 | function(fbbm, mat) { |
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| 30 | fd = file(fbbm, open='wb') |
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| 31 | if (is.matrix(mat)) { |
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| 32 | writeBin(dim(mat), fd) |
|---|
| 33 | writeBin(as.numeric(t(mat)), fd) |
|---|
| 34 | } else if (is.vector(mat)) { |
|---|
| 35 | Z <- matrix(mat,length(mat), 1) |
|---|
| 36 | writeBin(dim(Z), fd) |
|---|
| 37 | writeBin(as.numeric(t(Z)), fd) |
|---|
| 38 | } else { |
|---|
| 39 | writeBin(c(0,0), fd) |
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| 40 | } |
|---|
| 41 | close(fd) |
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| 42 | } |
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| 43 | |
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| 44 | ################################################################################ |
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| 45 | get.tol.arg <- |
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| 46 | ################################################################################ |
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| 47 | function(value, def) |
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| 48 | { |
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| 49 | if (is.null(value)) |
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| 50 | def |
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| 51 | else |
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| 52 | value |
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| 53 | } |
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